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常用生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析與應(yīng)用
本書(shū)共12章,從基礎(chǔ)理論到前沿技術(shù),構(gòu)建了完整的知識(shí)體系。開(kāi)篇介紹分子生物學(xué)基礎(chǔ)知識(shí)、生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的類型與來(lái)源,解析分析流程框架;隨后深入講解數(shù)據(jù)獲取與預(yù)處理,包括GEO數(shù)據(jù)庫(kù)檢索、芯片與二代測(cè)序數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化。核心章節(jié)圍繞R語(yǔ)言實(shí)操、常用工具包的使用、基因差異表達(dá)分析、機(jī)器學(xué)習(xí)特征篩選、WGCNA模塊挖掘、基因功能富集分析等關(guān)鍵技術(shù)展開(kāi)。書(shū)中還涵蓋蛋白表達(dá)數(shù)據(jù)挖掘(HPA、GEPIA數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)用)、生物分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建(STRING、Cytoscape工具使用)、生存分析與預(yù)后模型構(gòu)建等實(shí)用內(nèi)容,并針對(duì)多數(shù)據(jù)集整合分析、典型疾病案例(如腫瘤)進(jìn)行全流程復(fù)現(xiàn)。
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